Направления деятельности:

• изучение первичной структуры в первую очередь геномов вирусов гриппа, циркулирующих как в человеческой популяции, так и среди животных, а также изучение геномов других вирусных патогенов с гемагглютинирующей активностью (парамиксовирусы различных типов, в т.ч. вирус болезни Ньюкасла), циркулирующих в популяции птиц на территории азиатской части РФ.
• анализ аминокислотных замен, а также паттернов их накопления и фиксации, выявление изменений в антигенных детерминантах и функциональных участках белков вирусных патогенов.
• изучение генетических основ патогенеза гриппа.
• выявление вирусных патогенов в биологических пробах молекулярно-биологическими методами. Типирование и субтипирование вирусов гриппа, циркулирующих среди животных.
• разработка и апробация методов экспресс-идентификации вирусов гриппа типов А и B.
• изучение генетического разнообразия вирусных патогенов.

При участии Соболева И.А. были обнаружены и охарактеризованы уникальные варианты парамиксовирусов 1, 4 и 6 типов, а также вирусов гриппа птиц в азиатской части РФ, впервые в РФ исследована и охарактеризована вспышка нового патогенного реассортанта птичьего вируса гриппа A H5N8, обнаружен и охарактеризован уникальный генетический вариант (реассортант) вируса гриппа A(H1N1), циркулирующий в популяции свиней.

При участии Соболева И.А. выделено и охарактеризовано большое количество изолятов вируса гриппа различных субтипов; создана обширная коллекция штаммов. Штаммы вируса гриппа, выделенные от людей, птиц и свиней, депонированы в государственных коллекциях микроорганизмов ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» и ФГБУ «НИИ гриппа им. Смородинцева» МЗ РФ. Полученные в ходе работы последовательности геномов вирусов гриппа, парамиксовирусов птиц, респираторно-синцитиального вируса человека зарегистрированы в международных базах данных GenBank и GISAID. Эти исследования позволили выявить основные закономерности экологических связей в системе резервуаров вируса гриппа А, глобальных миграций вирусных популяций с птицами и млекопитающими (в т.ч. водными и околоводными). Определен район в Западной Сибири, имеющий ключевое значение для исследования миграций диких птиц и циркуляции вируса гриппа, связанного с данным природным резервуаром.

При участии Соболева И.А. на клиническом материале (около 3000 образцов мазков из носа и зева и около 4000 образцов сыворотки крови) проведен детальный анализ пандемии гриппа (2009 – 2010 гг.) и постпандемического периода в Западной Сибири, изучены основные антигенные, молекулярно-биологические, иммунологические свойства эпидемически значимых штаммов вируса гриппа.

Кроме того, начиная с 2013 г., Соболев И.А. участвует в регулярном мониторинге респираторных инфекций у детского населения г. Новосибирска в рамках договора о научном сотрудничестве с Детской клинической больницей №6. Показано, что более 70% острых респираторных заболеваний у детей имеют вирусную этиологию, при этом около 10% случаев ОРЗ вызваны вирусной ко-инфекцией. Определена этиологическая структура острых респираторных вирусных инфекций во время эпидемических сезонов с 2013 по 2017 гг..

С 2019 г. научный коллектив, в который входит Соболев ИА., совместно с «НИИ гриппа им. Смородинцева», являются участниками программы «Изучение роли вирусов гриппа в развитии тяжелых форм острых респираторных вирусных инфекций у госпитализированных пациентов», выполняемой в рамках системы «Глобальная госпитальная сеть надзора над гриппом». С этой целью были заключены договоры о научном сотрудничестве с инфекционными стационарами г. Новосибирска с целью сбора клинического материала от пациентов, госпитализированных с симптомами ОРВИ.

Награды и достижения:

1. Стипендия Правительства Новосибирской области «За значительные достижения в учебе, научной, научно-технической и творческой деятельности»
2. Именная стипендия наукограда Кольцово для аспирантов ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» (2012)
3. Премия для молодых ученых ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» за лучшую научную работу (2012)
4. Премия для молодых ученых ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» за лучшую научную публикацию (2012 г.).
5. Стипендия Президента Российской Федерации молодым ученым и аспирантам, осуществляющим перспективные научные исследования и разработки по приоритетным направлениям модернизации российской экономики, на 2019-2021 годы.

Публикации

Сотрудники лаборатории

1. Охлопкова Олеся Викторовна
   старший научный сотрудник, кандидат биологических наук
2. Пальянова Наталья Валерьевна
   младший научный сотрудник
3. Столбунова Кристина Александровна
   младший научный сотрудник (внеш. совм.)
4. Друзяка Ольга Руслановна
   младший научный сотрудник (внеш. совм.)
5. Мошкин Алексей Дмитриевич
   младший научный сотрудник (внеш. совм.)
6. Степанюк Марина Алексеевна
   младший научный сотрудник (внеш. совм.)
7. Леванова Наталья Максимовна
   лаборант