Лаборатория основана в 2015 году на фазе Федерального исследовательского центра фундаментальной и трансляционной медицины (ФИЦ ФТМ) в г. Новосибирске.

В 2021 году решением конкурсной Комиссии Минобрнауки лаборатория приобрела статус «Молодежной» с выделением гранта из Федерального бюджета в рамках национального проекта «Наука и университеты». Лаборатория входит в Научно-образовательный центр мирового уровня «Сибирский биотехнологический научно-образовательный центр» (представление на заседании Совета молодых ученых при Правительстве Новосибирской области от 14.10.2021)

Основные направления работ:

возникающие вирусы (emerging/re-emerging viruses), в том числе вирус птичьего гриппа, парамиксовирусы и коронавирусы животных. В лаборатории идет два больших международных проекта (Япония, Китай) в новой формирующейся области науки «Глобальный виром» (Global virome); ряд российских проектов (РФФИ, РНФ).

Цикл работ в международном коллективе по метагеномным исследованиям микробиома диких и домашних птиц различных видов, которые являются основным резурвуаром целого ряда зоонозных инфекций, основные результаты опубликованы в цикле статей.

Лаборатория является ведущим российским коллективом в области молекулярной эпидемиологии и экологии вирусов гриппа животных. Опубликована Монография по экологии вируса гриппа в Сибири- 2016 (De Marco, M.A., Sharshov, K., Gulyaeva, M., Delogu, M., Ciccarese, L., Castrucci, M.R., Shestopalov, A. Ecology of avian influenza viruses in Siberia (2016) Siberia: Ecology, Diversity and Environmental Impact, pp. 83-160. )

Методы исследования – молекулярно-биологические, вирусологические, серологические, культуральные, иммуногистохимические.

Шаршов Кирилл Александрович закончил в 2005 году Томский Государственный Университет и после его окончания был принят на работу в ГНЦ ВБ «Вектор», где прошел путь от стажера-исследователя до заведующего лабораторией. В августе 2013 года уволился из ГНЦ ВБ «Вектор» и был принят на должность старшего научного сотрудника в отдел экспериментального моделирования и патогенеза инфекционных заболеваний ФГБУ «НЦ КЭМ» СО РАМН, где через 2 года возглавил лабораторию.

В 2005-2008 гг. обучался в очной аспирантуре ГНЦ ВБ «Вектор» по специальности «вирусология». В 2010-2011 гг. Кирилл Александрович прошел курсы профессиональной переподготовки по программе «Первичной специализации врачей и биологов по работе с возбудителями особо опасных вирусных инфекций» (ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора).

В марте 2010 г. защитил кандидатскую диссертацию «Биологическое разнообразие штаммов вируса гриппа H5N1-субтипа, выделенных в России в 2005-2009 гг. от диких и домашних птиц».

Основная направленность работ Шаршова К.А. включает, но не ограничивается, следующими темами:

— мониторинг ряда зоонозных инфекций;

— молекулярная эпидемиология вирусов;

— патогенез инфекционных заболеваний (животные модели)

-диагностика некоторых значимых вирусных заболеваний с помощью молекулярно-биологических и иммунологических методов.

Кирилл Александрович принимает активное участие в разработке научных договоров, написании и выполнении научных проектов по конкурсам ФЦП, РНФ, РФФИ. Участвует в планировании, разработке и выполнении экспедиционных работ по сбору материала. Имеет опыт международных проектов (см список ниже) и более 15 заграничных командировок (конференции, стажировки, полевая и экспериментальная работа). Принимает участие в преподавательской деятельности. Имеет ряд наград и именных грантов, более 150 научных работ, более 10 патентов на изобретения. Руководитель 3 аспирантов.

Является экспертом Российского научного фонда (РНФ).

Награды и достижения руководителя лаборатории:

1. Номинация от Российской Федерации в международном конкурсе ASPIRE 2021.    https://www.apec.org/aspire/aspire2021/2021ASPIREnominees
2. Номинация от Российской Федерации на приз 7th BRICS YSF Award в области биомедицины на международном форуме стран БРИКС — 7th BRICS Young Scientist Forum с докладом «Avian influenza, COVID-19 and other biological threats in Asia: International cooperation»
3. Является официальным координатором Российского сектора Всемирного общества вирусологии (Membership Review Committee; Coordinator of Russian Sector of the World Society of Virology) — https://www.ws-virology.org/about-us/membership-review-committee/
4. Член оргкомитета Российского подразделения Международного центра по исследованию и раннему предупреждению гриппа, Пекин, Китайская Академия Наук (CAS Center for Influenza Research and Early-warning — CASCIRE) с 2017 года.  https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11427-017-9251-2
5. Является членом Европейского общества клинической микробиологии и инфекционных болезней (European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases);
6. Лауреат конкурса им. Н.К.Кольцова. Диплом II степени за лучшую научную работу (Дирекция ФГУН ГНЦ ВБ «Вектор», 2010 г.).
7. Именная премия наукограда Кольцово им. академика Л.С. Сандахчиева за значительные научные результаты фундаментального и прикладного характера (Администрация наукограда Кольцово, 2010 г.).
8. Лауреат премии им. Н.К.Кольцова. Диплом III степени за успехи в научной работе (Дирекция ФГУН ГНЦ ВБ «Вектор», 2011 г.).
9. Именной грант Правительства Новосибирской области Губернатор Новосибирской области 2013 г. на реализацию инновационного проекта (2013).

Проекты руководителя лаборатории:

Руководитель Международного Российско-Японского проекта: РНФ № 17-44-07001 «Прогнозирование распространения птичьего гриппа в России и Японии для предупреждения и контроля: роль Восточноазиатского-Австралийского пролетного пути в перемещении генов и реассортации вируса гриппа», 2017-2019 (руководитель Шаршов К.А.)

Руководитель Международного Российско-Японского проекта: РНФ № 20-44-07001 «Распространение РНК-вирусов птиц в Северной Азии и Азиатско-Тихоокеанском регионе: генетическое разнообразие, патогенный потенциал и прогнозирование влияния на птицеводство», 2020-2022 (руководитель Шаршов К.А.)

Руководитель 4 российских проектов:

РНФ 19-74-10055      «Сравнительная геномика, филогеографические паттерны и патогенный потенциал современных вариантов вирусов семейства Pneumoviridae» (руководитель Шаршов К.А.)

РФФИ 16-34-00306\16 «Реассортантные вирусы гриппа Центральной Азии: структурно-функциональные особенности и эволюционная динамика консервативных сегментов», 2016-2017 (руководитель Шаршов К.А.)

РФФИ 17-04-01919_А  «Особенности формирования гетерологичного генного пула РНК-содержащих орто- и парамиксовирусов у водных млекопитающих Каспийского моря», 2017-2019 (руководитель Шаршов К.А.)

в том числе, регионального проекта : Именной грант Правительства Новосибирской области «Изучение эпидемической значимости вирусов гриппа, циркулирующих в Новосибирской области в эпидемическом сезоне 2013-2014 гг.», 2013-2014 (руководитель Шаршов К.А.)

Публикации

Сотрудники лаборатории

1. Курская Ольга Григорьевна
   Старший научный сотрудник, кандидат медицинских наук
2. Соломатина Мария Владимировна
   старший научный сотрудник, кандидат биологических наук
3. Мурашкина Татьяна Александровна
   младший научный сотрудник, аспирант
4. Дубовицкий Никита Артемьевич
   младший научный сотрудник, аспирант
5. Дерко Анастасия Александровна
   младший научный сотрудник, аспирант
6. Жиров Дмитрий Александрович
   младший научный сотрудник, аспирант
7. Колотыгин Илья Олегович
   младший научный сотрудник, аспирант
8. Логинова Арина Максимовна
   Лаборант-исследователь
9. Лискевич Анастасия Александровна
   Лаборант-исследователь
10. Манеева Екатерина Павловна
    Лаборант-исследователь
11. Мещерякова Дарья Михайловна
    Лаборант-исследователь